Základní zajištění kaple proběhlo již v roce 2014 a 2018, kdy byla vyměněna prejzová střešní krytina a realizována odvodňovací drenáž po obvodu stavby. V roce 2025 se pozornost zaměřila na záchranu narušených částí a na zlepšení celkového stavu a vzhledu kaple. Před samotnými zásahy byly všechny části podrobně vyhodnoceny a na základě průzkumů byl zvolen nejvhodnější postup. Proběhla pečlivá repase a záchrana původních barokních oken, opraveny byly také vstupní dveře. Obnova fasády zahrnovala opravu a řemeslné doplnění omítky, ale také korekci druhotně deformovaných plastických článků. Barevnost nátěru fasády, oken i dveří byla zvolena na základě stratigrafického průzkumu. Upraveny byly i neproporční, druhotně použité stupně před vchodem. V interiéru kaple byla po sejmutí cementových dlaždic nalezena barokní cihelná podlaha, která byla opravena, chybějící části byly doplněny shodným typem dlaždic z téhož historického období.
V presbytáři restaurátorský průzkum prokázal přítomnost iluzivní výmalby, jež zahrnovala také nástěnný obraz titulárního světce kaple sv. Isidora Madridského a malby sv. Barbory a sv. Apoleny v nikách. Na základě tohoto nálezu bylo rozhodnuto sejmout z celého povrchu novodobý nátěr; v presbytáři byla malba celkově restaurována, včetně finálních retuší s dílčími rekonstrukcemi malby. Nad rámec původního záměru se vlastník rozhodl restaurovat také monochromní výmalbu v lodi kaple.
Všechny práce byly provedeny na nejvyšší řemeslné úrovni a za příkladné spolupráce všech zúčastněných stran. Podařilo se tak zachovat a citlivě obnovit všechny originální konstrukce a prvky, druhotně pozměněné či nesprávně opravované části byly rehabilitovány. Práce zároveň probíhaly důsledně s ohledem na plánované využití kaple, stavba tak může sloužit k liturgickým, kulturním i dalším společenským účelům.
Nominuje NPÚ, ÚOP středních Čech v Praze.
Na cenu NPÚ v kategorii Obnova památky 2026 je navržena obec Zákolany, zastoupená starostkou PhDr. Lucií Wittlichovou.