Věda a výzkum v památkové péči pokrývá široký rozsah statutárních činností organizace a zahrnuje mnoho oborů a specializací. Výzkumná činnost probíhá průřezově všemi pracovišti NPÚ, rozprostřenými po celém území České republiky. NPÚ spolupracuje na výzkumných projektech s vysokými školami, jinými státními příspěvkovými organizacemi a vědeckými a výzkumnými institucemi.
Provádění a organizování úkolů vědy a výzkumu v NPÚ je mnohovrstevnatý a složitý proces odborně i administrativně. Plynulou spolupráci mezi subjekty, podílejícími se na řešení projektů a komunikaci s poskytovatelem, zajišťuje oddělení vědy a výzkumu.
Aktivně se podílí na tvorbě koncepce vědecké a výzkumné činnosti NPÚ i na výběru, přípravě a vytváření výzkumných projektů a cílů. Průběžně zajišťuje aktivity Komise generální ředitelky NPÚ pro vědu a výzkum, na jejíž činnosti participuje, a chod Komise pro hodnocení výzkumných (grantových) projektů.
Výzkumná činnost NPÚ je průběžně financována z běžného rozpočtu s využitím institucionální podpory (IPDKRVO), finančních prostředků, získaných účastí ve veřejných soutěžích (NAKI, NAKI II, GAČR a jiné) a z dalších zdrojů financování.
(Výsledky aplikovaného výzkumu)
(Program aplikovaného výzkumu a vývoje národní a kulturní identity)
( Program na podporu aplikovaného výzkumu a experimentálního vývoje národní a kulturní identity na léta 2016 až 2022)
(Institucionální podpora na dlouhodobý koncepční rozvoj výzkumné organizace)
(Grantová agentura ČR)
(Program bezpečnostního výzkumu České republiky)